Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCGF6Q9BYE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms