Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A8Q9BY19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A8Q9BY19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms