Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRIP1Q9BX63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms