Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC94Q9BW85 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms