Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms