Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms