Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRACR2AQ9BSW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms