Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms