Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms