Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYM1Q9BRP8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PYM1Q9BRP8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYM1Q9BRP8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms