Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms