Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms