Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOSQ9BQE4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOSQ9BQE4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms