Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC3Q9BQ90 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms