Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCK3Q9BQ16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK3Q9BQ16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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