Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VGLL1Q99990 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms