Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF15Q99988 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms