Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKP2Q99959 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP2Q99959 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP2Q99959 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms