Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHP1Q99653 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHP1Q99653 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHP1Q99653 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHP1Q99653 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHP1Q99653 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHP1Q99653 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHP1Q99653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms