Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms