Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD1Q99460 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms