Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L3Q99457 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms