Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YME1L1Q96TA2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YME1L1Q96TA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms