Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP89Q96ST8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP89Q96ST8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms