Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACCSQ96QU6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms