Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARXQ96QS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms