Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms