Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q45

TMEM237, Transmembrane protein 237, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM237Q96Q45 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM237Q96Q45 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM237Q96Q45 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms