Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRNT1Q96Q11 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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