Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG4P5Q96PW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms