Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCLT1Q96NL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms