Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF396Q96N95 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms