Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROBO3Q96MS0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms