Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP4Q96MN2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP4Q96MN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms