Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE3Q96MG7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms