Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP8Q96LD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP8Q96LD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms