Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNH8Q96L42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KCNH8Q96L42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KCNH8Q96L42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms