Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms