Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms