Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A3Q96GZ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A3Q96GZ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms