Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms