Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms