Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms