Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPDL1Q96EA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPDL1Q96EA4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms