Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM44Q96DX7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms