Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE2Q96DL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE2Q96DL1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms