Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms