Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms