Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms