Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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